Głównym celem projektu jest poprawa, do roku 2023, stanu ochrony objętych działaniami projektowymi typów siedlisk i gatunków terenów nieleśnych zależnych od wód, których stan zachowania w dokumentach planistycznych został oceniony na niezadowalający (U1) lub zły (U2). Dokumenty te - plany zadań ochronnych lub plany ochrony - zawierają informacje na temat działań, które pozwolą na poprawę stanu ww. siedlisk i gatunków. W projekcie zawarto działania, które są kluczowe dla przywrócenia właściwego stanu bądź zatrzymania negatywnego trendu zmian.

Cele szczegółowe projektu są następujące:

• Wypełnienie zobowiązań wynikających z ustanowionych planów zadań ochronnych lub planów ochrony dla obszarów Natura 2000;
• Poprawa stanu zachowania siedlisk przyrodniczych oraz populacji gatunków poprzez zrealizowanie działań związanych z powstrzymaniem sukcesji naturalnej na terenie ich występowania oraz zmianą stosunków wodnych (budowa zastawek, zasypywanie rowów melioracyjnych itp.);
• Ochrona siedlisk przyrodniczych oraz siedlisk gatunków poprzez wykup gruntów kluczowych dla poprawy stanu ich ochrony;
• Upowszechnienie wiedzy o wymogach ochronnych siedlisk przyrodniczych i gatunków.