Grupą docelową projektu „Opracowanie planów zadań ochronnych dla obszarów Natura 2000 na obszarze Polski" jest ogół społeczeństwa, ze szczególnym uwzględnieniem instytucji związanych z ochroną przyrody oraz społeczności lokalnych w gminach, na których terenach są wyznaczone obszary Natura 2000 objęte działaniami w projekcie.